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當獲得多個雜交瘤細胞株時，要了解哪一株是適用的，則一定要通過各種鑒定。分析常見的方法有：
1、Ig類型測定
通常以免抗小鼠Ig類及亞類抗體與培養液中單克隆抗體按雙向瓊脂擴散法進行測定，確定其Ig類型或Ig亞類型別。
2、特異性測定
把與相應抗原有關的物質同McAb進行多種免疫學檢測，鑒定McAb的特異性。這直接關系到McAb應用的可靠性。
3、抗體效價測定
效價以腹腔積液或培養液的稀釋度表示，稀釋度越高，則抗體效價也越高。在凝集反應中，腹腔積液效價可達5萬以上；在ELISA中，腹腔積液效價可達100萬以上。如ELISA效價低于10萬，用于診斷測定將不會達到很高的敏感度，應重新制備。
4、表位測定
通過雙向瓊脂擴散法，把兩種McAb混合，加入于同一孔中，對孔放相應的抗原，如出現兩條沉淀線可證明兩者為抗不同表位的McAb；利用ELISA雙抗夾心法，將一種McAb作包被抗體，另一作酶標記，其中加入抗原，如顯色，則證明兩者抗不同的表位。
5、親和力測定
只有當抗原與抗體結合部位結構全吻合時，抗體的親和力。這種結合力以抗原抗體反應平衡時，抗原與抗體濃度的乘積與抗原抗體復合物濃度之比表示。如親和力太低，會嚴重影響測定的敏感性。
6、染色體分析
正常鼠的脾細胞染色體數：40，全部為端著絲粒；小鼠骨髓瘤細胞染色體：SP2／0細胞為62—68，NS-1為54～64。大多數為非整倍性，有中部和亞中部著絲點。雜交瘤細胞的染色體數目接近兩親本細胞染色體數目的總和，在結構上多數為端著絲粒染色體外．還應出現少數標志染色體。染色體數目多且較集中的雜交瘤細胞分泌高效價的抗體。
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