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澤瀉探針法PCR鑒定試劑盒試驗循環(huán)參數(shù):
1. 預(yù)變性(Initial denaturation)
模板DNA變性與PCR酶的激活對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時間為兩分鐘。
2. 循環(huán)中的變性步驟
循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列變性,可能的情況下可 縮短該步驟時間,變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不好,易造成擴增失敗。
3. 引物退火(Primer annealing)
退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴增的長度適當(dāng)下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實驗基礎(chǔ)上做出預(yù)估。
退火溫度對PCR的特異性有較大影響。
4. 引物延伸
引物延伸一般在72℃進行(Taq酶最適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略
延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設(shè)定為1 min/kbp。
5. 循環(huán)數(shù)
大多數(shù)PCR含25-40循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴增。
6. 最后延伸
在最后一個循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。
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