從經濟的角度出發，或者購買不方便，或是認識上的問題等，目前我國有相當數量的液相色譜用戶在使用分析純的溶劑作流動相。采用分析純的溶劑存在的問題是：
1分析純試劑中的部分雜質或懸浮物會吸附在柱內的填料上，影響柱壽命；
2分析純試劑由于雜質較多會使流動相的截止吸收波長抬高；
3由于分析純試劑多為國產試劑，質量不穩定而且良莠不齊，給應用帶來諸多不便。
但是，考慮到實際上今后仍會有大量用戶使用分析純試劑做流動相，所以下面介紹一些處理方法和注意事項。
1使用前先用氣相色譜看一下純度，有時國產試劑會以次充好，用工業品不經嚴格處理而直接灌裝冒充分析純。
2用不大于0.45微米的濾膜嚴格過濾，除去雜質和懸浮物。
3做紫外掃描，測定不同波長的吸收度，同色譜級的試劑進行比較。觀察紫外吸收和截止波長是否干擾測定。
4如果是少量加入的溶劑，一般對較高波長下等度分析影響不大。
5另外，如果用于離子色譜，還要考慮無機離子的殘留，國產試劑中甚至色譜純的試劑都很少會考慮這一點。如果用于ELSD，其殘留的顆粒更應注意，過多過大的顆粒會增加噪音。
6對于一些昂貴的試劑，可以采用精餾或吸附劑處理等方法精制，如用硅膠柱吸附分析純正己烷中的芳香烴物質，減壓精餾分析純四氫呋喃除去氧化物和高紫外吸收物質。
總之，雖然有些分析純的試劑在較高波長和質量較好時，可以滿足一般色譜分析的要求，但為了延長儀器和色譜柱的壽命，建議盡量采用色譜流動相級的試劑作流動相。
