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閱讀:581發(fā)布時(shí)間:2016-3-3
優(yōu)化sgRNA結(jié)構(gòu)可提高基因編輯效率!
在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)德州理工大學(xué)健康科學(xué)中心的研究人員開(kāi)發(fā)出一種提高CRISPR基因編輯效率的方法,其中CRISPR是一種日漸重要的用來(lái)編輯DNA的技術(shù)。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在Genome Biology期刊上,論文標(biāo)題為“Optimizing sgRNA structure to improve CRISPR-Cas9 knockout efficiency”。論文通信作者是Haoquan Wu博士。他是德州理工大學(xué)健康科學(xué)中心的一名生物醫(yī)學(xué)家。
Wu說(shuō),“*的科學(xué)家們?nèi)缃裾谒麄兊难芯恐惺褂肅RISPR,但是這種技術(shù)的功能性并不像是它應(yīng)當(dāng)那樣的那么好。”
CRISPR是一種突破性的允許科學(xué)家們對(duì)基因進(jìn)行修飾的技術(shù)。兩種關(guān)鍵性的組分讓CRISPR的DNA編輯能力成為可能。*種組分是Cas9,即一種能夠切割DNA的酶。第二種組分是單向?qū)NA(single guide RNA, sgRNA),它地引導(dǎo)Cas9在一種DNA序列上進(jìn)行切割從而讓不需要的片段失活。
然而,作為一種新技術(shù),CRISPR仍然還有改善的空間。這種技術(shù)剔除或敲除基因的能力并不是始終一致的。這些問(wèn)題促使Wu想知道他是否能夠提高CRISPR作用于靶基因并將其移除的整體能力。為此,他想看看改變sgRNA的結(jié)構(gòu)是否能夠讓這種技術(shù)變得更好。
在這項(xiàng)新的研究中,Wu和他的研究小組描述了他們?nèi)绾文軌蛲ㄟ^(guò)調(diào)整sgRNA模板的序列讓基于CRISPR的基因敲除能力提高了50%。他們特異性地將sgRNA延長(zhǎng)大約5個(gè)堿基對(duì)(bp),同時(shí)也將sgRNA中的一串胸腺嘧啶(T)的第四個(gè)堿基T突變?yōu)榘奏ぃ–)或*(G)。
Wu說(shuō),“通過(guò)這些優(yōu)化,基因敲除效率提高的程度是顯著性的。這將有助降低基因敲除實(shí)驗(yàn)可能并不成功的擔(dān)憂,而且也顯著增加更多充滿挑戰(zhàn)性的諸如基因剔除之類的基因編輯方法的效率。”
Wu和他的研究小組計(jì)劃繼續(xù)研究這種經(jīng)過(guò)修飾的sgRNA模板以便更好地理解它為何提高CRISPR的基因編輯功能。他們已經(jīng)將這種新的方法申請(qǐng)了。
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