脫硫系統是為沼氣燃燒、沼氣發電等定向設計的主要工藝。結合沼氣的實際需要，對沼氣進行了系統的脫硫和脫水。脫硫采用物理化學結合，脫水采用機械、汽水分離膜技術，整個脫硫脫水處理工藝高效簡單，管理方便，運行成本低。
干法脫硫是一種簡易、高效、相對低成本的脫硫方式，一般適合用于沼氣量小，硫化氫濃度低的沼氣脫硫。干法脫除沼氣氣體中硫化氫（H2S）的設備基本原理是以O2使H2S 氧化成硫或硫氧化物的一種方法，也可稱為干式氧化法。干法設備的構成是，在一個容器內放入填料，填料層有活性炭、氧化鐵等。氣體以低流速從一端經過容器內填料層，硫化氫（H2S）氧化成硫或硫氧化物后，余留在填料層中，凈化后氣體從容器另一端排出。
通過脫硫后的凈化沼氣進入沼氣增壓風機增壓輸送，一方面克服管道、設備、管件的阻力損失，另一方面使輸送至發電機組前的沼氣壓力滿足機組的進氣壓力要求。考慮到沼氣是一種易燃易爆的危性氣體，本方案中選用的增壓風機進行了特殊的內部處理，以滿足防腐、防爆、防泄露的安全性要求，保證整個脫硫脫水系統的安全。增壓后的沼氣進入緩沖罐，實現氣液固的有效分離，同時達到進行氣體穩壓處理，以滿足對發電機組的平穩供氣，保證發電機組的安全、高效運行。
