純化水系統主要用于非無菌藥品的配料、洗瓶、注射劑瓶子的清洗、非無菌原料的精制。純化水的制備有過濾、吸附、軟化、反滲透、離子交換、電法去離子(EDI)微孔過濾(超濾)。
GMP認證制藥用純化水設備要求：結構設計應簡單、可靠、拆裝簡便；為便于拆裝、更換、清洗零件，執行機構的設計盡量采用的標準化、通用化、系統化零部件；設備內外壁表面，要求光滑平整，容易清洗、滅菌。零件表面應做鍍鉻等表面處理，以耐腐蝕，防止生銹。設備外面避免用油漆，以防剝落。；制備純化水設備應采用低碳不銹鋼或其他經驗證不污染水質的材料。
制備純化水的設備應定期清洗，并對清洗效果驗證；注射用水接觸的材料必須是優質低碳不銹鋼或其他經驗證不對水質產生污染的 材料。制備注射用水的設備應定期清洗，并對清洗效果驗證；純化水儲存周期不宜大于24小時，其儲罐宜采用不銹鋼材料或經驗證無毒，耐腐蝕，不滲出污染離子的其他材料制作。保護其通氣口應安裝不脫落纖維的疏水性除菌濾器。儲罐內壁應光滑，接管和焊縫不應有死角和沙眼。應采用不會形成滯水污染的顯示液面、溫度壓力等參數的傳感器。對儲罐要定期清洗、消毒滅菌，并對清洗、滅菌效果驗證；制藥用水的輸送；壓力容器的設計，須由有許可證的單位及合格人員承擔，須按中華人民共和國國家標準《鋼制壓力容器》(GB150-80)及"壓力容器安全技術監察規程"的有關規定辦理。
